2018年7月に登録となった世界文化遺産「長崎と天草地方の潜伏キリシタン関連遺産」と、久賀島の文化的景観に関する情報発信拠点施設です。島の中心部に位置する古民家「藤原邸」を改修し開設されました。

久賀島観光交流拠点センターでは、世界遺産や久賀島の文化的景観に関するパネルが展示されているほか、写真やマップを用いて島のおすすめ観光スポットが紹介されています。

また、交流・休憩の場として、日本庭園を眺めながら飲食・休憩できるスペースがあり、飲食コーナーでは、久賀島産の食材を使った和食を食べることもできます（要事前予約）。物販コーナーでは久賀島産のお土産も販売されています。

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