長崎観光/旅行ポータルサイト ながさき旅ネット

本館は、明治10年（1877）にキリスト教新教の神学校として建設された「出島神学校」を保存修理した木造2階建ての建造物です。
1階では、出島の歴史と生活をテーマにして、出島誕生の経緯・出島での貿易品・オランダ商館員の生活を、資料や模型、グラフィックパネルで紹介しています。2階では、日本の窓「出島」というテーマで、出島を通じて入ってきた学問や動植物、オランダ商館員が研究した日本について紹介しています。
分館は、安政の開国以降に建設された石倉を昭和31年(1956)に復元したものです。
史跡内から出土した遺物を中心に本館の補完的な展示を行っています。